Augmentation transitoire des maladies diarrhéiques après le séisme dévastateur à Kocaeli, Turquie: résultats d’une étude de surveillance des maladies infectieuses

Immédiatement après le tremblement de terre dévastateur survenu en août en Turquie, un système de surveillance des maladies infectieuses a été mis en place dans la province de Kocaeli. Cette étude de surveillance était principalement centrée sur les maladies diarrhéiques Pendant une journée, les cultures de selles ont été traitées. Les cas ont été dispersés dans toute la région, et les causes identifiées étaient diverses, indiquant une augmentation multifocale. Parmi les causes identifiées, les espèces de Shigella étaient les plus communes. appartenant à des sérotypes et des clones distincts Cette étude a indiqué une augmentation multifocale et multiclonale des maladies diarrhéiques après cette catastrophe massive, indiquant ainsi la nécessité de mettre en place des systèmes de surveillance des maladies infectieuses après de tels événements.

Les tremblements de terre sont parmi les catastrophes naturelles les plus importantes qui causent des urgences de masse Selon la nature et l’emplacement de ces catastrophes, diverses infections ont causé des problèmes dans le passé Le tremblement de terre d’août en Turquie a affecté une superficie de km , les gens sont morts, et, ont été laissés sans abri La province de Kocaeli était la plus grande zone touchée environ deux tiers de toutes les zones touchées étaient dans la province de Kocaeli L’infrastructure de la région, y compris le système d’approvisionnement en eau, a été lourdement De plus, le changement soudain de la nourriture et des conditions de vie compliquait la défense de la population contre les maladies infectieuses. Les circonstances de la propagation des agents infectieux étaient plus appropriées que jamais. base de ces circonstances, un système de surveillance permettant de détecter et de contrôler les éclosions de maladies infectieuses a été établi. Après le tremblement de terre dans la province de Kocaeli, nous présentons ici les résultats et les enseignements tirés de cette étude de surveillance des maladies infectieuses

Matériaux et méthodes

Conception de l’étude de surveillance

Le plan de surveillance et de contrôle des flambées était basé sur des paramètres: les zones les plus probables, les voies les plus probables de propagation des infections et les agents étiologiques les plus probables. Nous avons divisé la province de Kocaeli en zones: zone A, zone B, zone périphérique et périphérique. Les zones A et B étaient les côtés opposés du golfe d’Izmit La zone centrale était Centrum et la zone la plus proche du centre de la ville Toutes les autres villes et villages étaient des zones périphériques Les zones A et B faisaient face au centre du tremblement de terre sur les rives opposées du golfe d’Izmit; par conséquent, ces zones ont subi de graves dommages aux bâtiments et à l’infrastructure. La zone centrale, en revanche, était la zone où les dégâts étaient relativement moindres. Cependant, les répliques ont continué, et un grand nombre de personnes vivaient dans des tentes. Les zones périphériques ont le moins de dommages; En raison de l’été chaud, de l’infrastructure endommagée et des difficultés à obtenir de l’eau potable, nous avons supposé que les maladies d’origine hydrique étaient les principales menaces de maladie. Microorganismes qui se propagent par l’eau et qui ont été vus Les micro-organismes étaient les espèces de Shigella, les espèces de Salmonella et Giardia intestinalis. Le système de surveillance était composé d’un laboratoire, d’une salle des maladies infectieuses et d’équipes d’ambulances. En laboratoire, un ordinateur était réservé cette étude Une base de données basée sur le questionnaire utilisé dans l’étude de surveillance a été préparée. La diarrhée a été définie comme suit: st selles liquides par jour. Séparer les protocoles des maladies diarrhéiques pour les organismes de santé de première étape situés dans des zones où le risque de flambées était élevé. centre de surveillance ont été préparés des équipes d’ambulance ont distribué des médias de transport et d’étude des protocoles aux organismes de santé de première étape et les a visités, ainsi que les camps de tentes situés dans ces régions, tous les jours. Le but était de diriger les échantillons de selles ou les patients vers le centre de surveillance.

Études de laboratoire en microbiologie

Un laboratoire de microbiologie a été créé pour identifier les agents bactériens et protozoaires communs responsables des maladies infectieuses d’origine hydrique. Les échantillons ont été prélevés soit dans des récipients spéciaux, soit dans des prélèvements rectaux. Les échantillons de selles ont été traités immédiatement: MacConkey agar, agar de salmonella-shigella, et citrate de thiosulfate, sels biliaires saccharose agar; deuxièmement, un examen microscopique direct a été effectué Tous les milieux étaient prêts à utiliser EKBAK, Istanbul, Turquie L’agar MacConkey et la gélose Salmonella-Shigella ont été utilisés pour la détection des espèces Salmonella et Shigella, tandis que les sels biliaires de citrate de thiosulfate Les colonies suspectes ont été repiquées sur gélose au triple sucre et gélose au sang. Après incubation pendant plusieurs heures à ° C, des bactéries non fermant le lactose ont été testées pour l’agglutination avec des antisérums spécifiques aux espèces Shigella, L’examen microscopique direct a permis de documenter le nombre de leucocytes par champ de forte puissance Bien que les protozoaires facilement identifiables par examen direct aient été inclus dans l’analyse de détection, ceux nécessitant des techniques de coloration spéciales, telles que Entamoeba histolytica, ont été omis de cette analyseLe but du laboratoire de microbiologie Le protocole de l’étude consistait à détecter les micro-organismes les plus probables. Des méthodes, des protocoles et des techniques plus sophistiqués n’étaient pas applicables dans ces conditions.

Tests de sensibilité aux antibiotiques et études d’ADN

Des tests de dilution en gélose pour la sensibilité aux antibiotiques ont été effectués sur la gélose Mueller-Hinton Oxoid, Oxoid, Basingstoke, Royaume-Uni selon les recommandations du Comité National pour les Normes Cliniques de Laboratoire En bref, des ufc de bactéries ont été inoculées sur Mueller fraîchement préparé. – des boîtes de gélose Hinton contenant des dilutions en série des antibiotiques apparentés au moyen d’un inoculateur multipoint; Les plaques d’agar ont été évaluées après des heures d’incubation à ° C, et les CMI ont été déterminées. On a utilisé des formes en poudre des antibiotiques suivants: ceftazidime Glaxo-Wellcome, Istanbul; l’ampicilline Pfizer, Istanbul; ciprofloxacine Bayer, Istanbul; la gentamicine, la tetracycline et le chloramphenicol Sigma, St Louis; et triméthoprime-sulfaméthoxazole Roche Diagnostic Systems, IstanbulL’ADN chromosomique total a été détecté par l’effet lytique du SDS et du bromure de cétyltriméthylammonium En résumé, une suspension dense de bactéries a été obtenue à partir d’une plaque d’agar incubée pendant la nuit et lysée: et a: volume de protéinase K pendant heure à ° C L’addition d’un: volume de NaCI M et de: volume de bromure de cétyltriméthylammonium et incubation pendant minutes à ° C achevait l’étape de lyse. L’ADN était extrait avec du chloroforme / alcool isoamylique: volume et a été précipité avec du -propanol volume / volume de l’ADN a été recueilli par un embout de pipette et a été transféré dans un tube Eppendorf-mL propre; l’ADN a été lavé – fois avec du tampon Tris-EDTA et remis en suspension dans un tampon Tris-EDTA. Une comparaison RAPD de l’ADN polymorphe amplifié par Random a été réalisée par des amorces sélectionnées au hasard et un recuit à basse température dans une analyse PCR. Les séquences des amorces étaient ‘-AAC Les données non publiées des auteurs TCC GTG TCG CCC TTA T ‘et’ -ATT TTC TTA GCG ACG TAC- ‘OPR Le cycle thermique a été réalisé dans un thermocycleur à couvercle chauffant, sans couche d’huile minérale, après un … étape de dénaturation minute à ° C Il y avait des cycles de ° C pour s, ° C pour s, et ° C pour s qui ont été suivis par des cycles de ° C pour s, ° C pour s, et ° C pour s, et un final cycle de ° C pendant une nuit Une électrophorèse sous-marine horizontale des produits de PCR a été effectuée sur un gel d’agarose en%; ensuite les produits de PCR ont été colorés avec du bromure d’éthidium et visualisés sous une lampe ultraviolette. La digestion par endonucléase RES de restriction a été effectuée en volumes totaux de -lL avec des ul de l’ADN chromosomique total et U de EcoRI Fermentas, NBI Fermentas; Vilnius, Lituanie à ° C pendant des heures L’électrophorèse du produit de digestion a été effectuée à V / cm pendant des heures sur un gel d’agarose%, et le produit a été coloré et visualisé comme décrit ci-dessus.

Résultats

Un total de cultures de selles a été traité entre août et septembre. Selon notre procédure de diagnostic,% des échantillons de selles étaient négatifs. Les causes identifiées de la diarrhée étaient les suivantes: espèces de Shigella, selles%; Espèces de Salmonella, selles%; Espèce Aeromonas, selles%; G intestinalis, selles%; et Blastocystis hominis, selles% Les cas de diarrhée, par rapport à la taille de la population réelle, ont été dispersés presque proportionnellement entre les zones Cependant, l’analyse a révélé que les cas n’étaient pas distribués uniformément dans la période d’étude. par étape après août et a diminué au plus bas niveau en septembre; le nombre de cas a continué à être faible pour & gt; données mensuelles non montrées Ces données indiquent une augmentation temporaire des maladies diarrhéiques

Figure vue grandDownload slideDistribution du nombre total de cas de maladie diarrhéique après le tremblement de terre à Kocaeli, Turquie, en haut; nombre de cas dans lesquels les isolats de Shigella ont été récupérés, par date bottomFigure View largeTélécharger slideDistribution du nombre total de cas de maladie diarrhéique après le tremblement de terre à Kocaeli, Turquie, en haut; Le nombre le plus élevé d’isolats de Shigella a été retrouvé dans la zone centrale. Parmi les isolats de Shigella, S flexneri de la zone centrale, S sonnei de la zone centrale, était S boydii de la zone centrale, et S dysenteriae tous de la zone centrale Si une éclosion de shigella s’est produite pendant ce temps, elle devait être dans la zone centrale et était probablement causée par le sérotype le plus commun. si les infections à S. flexneri dans la zone centrale étaient causées par la propagation d’une seule souche ou si elles étaient causées par des souches différentes S’il s’agissait d’une épidémie, les isolats de S. flexneri de la zone centrale devaient appartenir à un seul clone. Les isolats de Shigella, les profils de résistance aux antibiotiques ont été comparés pour l’analyse phénotypique, et les analyses RAPD et RE ont été effectuées pour des comparaisons génotypiques. On a observé des profils de résistance aux antibiotiques pour des isolats de Shigella choisis au hasard dans la zone centrale des isolats de Shigella, S flexneri, pour lesquels des profils de résistance aux antibiotiques ont été détectés dans des comparaisons génotypiques, qui étudiaient uniquement les isolats de S. flexneri de la zone centrale. détectés par l’analyse RAPD, et les génotypes ont été détectés par l’analyse RE Figure Ces comparaisons ont indiqué que, même dans la zone centrale, & gt; Le clone de Shigella a causé la diarrhée

Figure View largeTélécharger slideRandom ADN polymorphe amplifié RAPD analyse A et endonucléase de restriction RE analyse B des isolats de Shigella flexneri de la zone centrale après le tremblement de terre à Kocaeli, Turquie, dans Lane MA, marqueur de taille d’ADN Lanes et A dans RAPD, et voies et B Analyse de RAPD de l’endonucléase A et de l’endonucléase de restriction B des isolats de Shigella flexneri de la zone centrale après le tremblement de terre à Kocaeli, Turquie, dans Lane MA, marqueur de taille d’ADN Lanes et A dans les modèles RAPD, et les voies et B dans les modèles de comparaison RE sont distincts du reste

Discussion

Les données obtenues dans cette étude de surveillance montrent que les maladies diarrhéiques ont augmenté transitoirement après le tremblement de terre de Kocaeli (Turquie). Bien que l’étiologie du% de tous les cas de diarrhée n’ait pu être identifiée, la distribution presque proportionnelle des cas entre zones distinctes nous a permis de juger. cette augmentation comme multifocale De même, cette étude a également montré que les infections à shigella ont augmenté au début de la période, en fonction des données obtenues par des comparaisons phénotypiques et génotypiques, & gt; sérotype et & gt; Le clone de Shigella a provoqué la diarrhée. La propagation multiclonale des infections à Shigella a été quelque peu différente de celle d’une véritable épidémie. Un autre point important est que les maladies diarrhéiques dans la province de Kocaeli jours et simultanément dans des zones distinctes, ce qui n’est pas une caractéristique conventionnelle de la dissémination d’un seul microorganisme à partir d’une source uniqueSigella est strictement un pathogène humain, et sa dissémination reflète, dans une certaine mesure, la contamination de l’eau et des aliments. Cependant, à notre avis, cette augmentation multifocale de toutes les formes de maladies diarrhéiques ne peut s’expliquer uniquement par la contamination de l’approvisionnement en eau. Cette augmentation doit en être la conséquence. de multiples paramètres, et une explication simple ne pourrait probablement jamais être Au-delà de toutes les autres explications, l’instabilité émotionnelle due à une profonde dépression et un changement soudain des conditions de vie et d’alimentation des habitants pourrait expliquer cette augmentation multifocale: d’abord, l’instabilité émotionnelle pourrait causer la diarrhée et pourrait être la cause de certains cas; Deuxièmement, une dépression profonde pourrait rendre les gens moins immunisés et plus sensibles aux maladies. Cette étude a démontré que les gens sont plus enclins à certaines infections après des urgences de masse Dans ces conditions, un système de surveillance est essentiel pour détecter une augmentation des maladies. les études sont essentielles pour différencier une véritable épidémie Cette différenciation est particulièrement importante, car des mesures plus strictes, telles que la mise en quarantaine, devraient être appliquées dans une véritable épidémie.

Remerciements

Les auteurs remercient Türk infeksiyon vakfý d’avoir soutenu le laboratoire de surveillance et tout le personnel médical qui a été bénévole après cette catastrophe