Présence d’une mutation multi-résistante dans une variante du VIH infectant un individu naïf de traitement à Caio, Guinée-Bissau

Nous rapportons que la transmission possible d’un virus de l’immunodéficience humaine résistante aux médicaments de type A, une femme de la Guinée Bissau rurale qui n’avait pas d’antirétroviraux évidents, a révélé une mutation avec la mutation multi-résistance QM Trouver cette mutation parmi les naïfs de drogue la population présente un problème important de santé publique qui doit être traité pour que le traitement soit efficace

La transmission du virus de l’immunodéficience humaine pharmacorésistant de type VIH a été signalée dans plusieurs pays développés, avec des prévalences allant de% à% des infections par le VIH Des incidents fréquents aux Etats-Unis ont conduit à de nouvelles directives L’accès aux antirétroviraux en Afrique a fait des études sur la résistance aux antirétroviraux de type VIH une priorité Les antirétroviraux n’étaient pas officiellement disponibles à Caio, en Guinée Bissau, en attendant la préparation du traitement. , les patients ont été sélectionnés au hasard pour la présence de mutations pharmacorésistantes, afin de maximiser l’efficacité du traitement de première ligne Nous rapportons ici la présence d’une mutation multirésistante dans un variant VIH infectant un individu naïf de traitement dans CaioMethods The Caio cohorte a été initiée pour étudier l’épidémiologie de l’infection à VIH Caio, située dans la partie nord-ouest de la Guinée Bissau, est une communauté rurale sans eau courante ni électricité Trois enquêtes sérologiques ont été menées à Caio au cours de -, – et – à l’échelle de la population pour déterminer le statut VIH de ses habitants. Dans certains cas, des membres de la cohorte ont été inclus dans une étude cas-témoin. Il a été établi que de nombreux villageois vivent et travaillent principalement dans les grandes villes de la sous-région, au Portugal ou en France et qu’un nombre substantiel de femmes travaillent dans les villes de Caio. ou ont travaillé comme travailleurs du sexe dans la capitale, Bissau, ou dans les pays voisins La prévalence de l’infection à VIH a augmenté progressivement de% pendant – à% pendant – à% pendant -, tandis que la prévalence de l’infection à VIH diminuait % pendant – à% pendant – à% pendant – Entre chaque enquête sérologique, les personnes infectées par le VIH ont été suivies plus régulièrement et ont eu un accès gratuit aux soins cliniques Tous les participants à l’étude dans la cohorte le traitement antirétroviral était-il naïf et donnait-il un consentement éclairé? Les résultats du dépistage du VIH étaient disponibles sur demande; La plupart des participants n’ont pas cherché leurs résultats. Le Comité d’éthique du gouvernement gambien et du Comité national de lutte contre le SIDA de la Guinée Bissau a approuvé cette étude. Les cellules T ont été quantifiées par cytométrie en flux et la charge virale plasmatique en copies d’ARN du VIH par millilitre mesuré par un test interne, comme décrit ailleurs VIH-ARN ou ADN a été amplifié et directement séquencé comme décrit ailleurs Les séquences générées ont été affectées aux numéros d’accès GenBank AM-AM et FM Virus a été analysé par des méthodes génotypiques, séquençage et le test de ligature oligonucléotidique OLA Le VIH-OLA pour les mutations QM et MV a été décrit ailleurs Résultats L’analyse phylogénétique a montré que les échantillons VIH de tous les patients étaient sous-type A Des patients dont le virus était génotypé, ont été infectés par VIH-As de type sauvage a été observé pour d’autres échantillons de type sauvage de VIH , certaines mutations de résistance au VIH dans la protéase LV, KR, LV, VI, MI, MI , IV, IV, AV, GA et IL [données non présentées] et la transcriptase inverse VI et KQ / E [tableau] ont été trouvés comme des polymorphismes naturels dans les échantillons de VIH analysés ici Dans le virus d’un patient, un multi-nucléoside inverse- Une mutation de la résistance NRTI, QM, a été découverte Deux autres échantillons de ce patient ont également été génotypés, et cette mutation était présente dans les deux tableaux. Le séquençage et les résultats OLA étaient concordants

Au cours de ces enquêtes sérologiques, aucune utilisation d’antirétroviraux n’a été enregistrée et les réponses n’ont pas suggéré que les patients séropositifs recevaient un traitement antirétroviral. Le patient de l’index a été suivi depuis, mais n’a jamais demandé de traitement antirétroviral. Pour voir les résultats de son test VIH Pendant l’examen clinique, le médecin et le travailleur de terrain ont noté que la patiente n’était pas consciente de son statut VIH. Cependant, lorsque les antirétroviraux sont disponibles à Caio, la patiente a été informée de son statut VIH. Le traitement antirétroviral de première intention à Caio est la zidovudine, la lamivudine et la névirapine pour l’infection par le VIH et la zidovudine, la lamivudine et l’indinavir / ritonavir contre l’infection par le VIH. Tous les échantillons disponibles proviennent de ce patient. , et ont été génotypés, et la présence de la mutation QM qui est associée à la résistance phénotypique aux NRTI zidovudine, didan l’osine, la zalcitabine, l’abacavir et la stavudine dans l’infection par le VIH et le VIH – ont été révélés dans tous les cas Les résultats des questionnaires et le fait que la patiente de l’index ne semblait pas connaître son statut sérologique au moment des prélèvements Les résultats obtenus semblent indiquer qu’elle n’a jamais été traitée, ce qui suggère qu’elle aurait pu être infectée par une souche de VIH résistante aux médicaments. Discussion Pour l’infection par le VIH, les options de traitement limitées résultant de la résistance naturelle ont fait le choix d’une L’utilisation généralisée des antirétroviraux pour le traitement de l’infection par le VIH a entraîné une augmentation de la transmission des virus pharmacorésistants. Il est donc important de dépister les patients naïfs de traitement qui sont sur le point d’initier un traitement. Bien que le moment précis de la séroconversion ne puisse être déterminé pour le patient index, plusieurs facteurs indiquent que la présence de la mutation QM est probablement le résultat de transmission de virus pharmacorésistants et non d’une exposition antérieure à des médicaments Les mutations de résistance aux médicaments peuvent survenir par évolution naturelle ou peuvent être sélectionnées en présence de pression médicamenteuse. Cependant, les mutations primaires, qui causent une résistance élevée, ne devraient pas se produire naturellement. -naive individus, parce que l’acquisition de mutations primaires est, à quelques exceptions près, généralement associée à une perte significative de la condition physique en l’absence de pression médicamenteuse Par conséquent, pour les patients non traités la présence de mutations primaires le VIH résistant aux médicaments, alors que la présence de mutations secondaires est associée à des polymorphismes naturels La mutation QM n’a pas été observée comme un polymorphisme naturel dans l’un des variants connus du VIH; sa présence a été associée uniquement au traitement par NRTIQM est une mutation de résistance primaire associée à une résistance aux multi-NRTI dans les infections à VIH et au VIH. Bien que rare dans l’infection par le VIH, elle survient plus fréquemment dans l’infection par le VIH. les mutations primaires sont généralement moins ajustées que leurs homologues de type sauvage, les mutants QM font partie des rares exceptions – la présence de QM augmente en fait l’aptitude du virus mutant L’aptitude améliorée des mutants QM peut expliquer la persistance apparente et la stabilité des mutants. Cette mutation chez notre patient En outre, il a été démontré que, contrairement aux interruptions de traitement, les virus pharmacorésistants transmis peuvent persister pendant de nombreuses années . Pendant la transmission des virus pharmacorésistants, ces variants résistants représentent la majorité des quasi-espèces. et, dans la plupart des cas, les virus de type sauvage ne seront pas transmis. Par conséquent, aucun virus de type sauvage latent ou archivé ne sera présent pour concurrencer Les antirétroviraux n’ont pas été largement utilisés en Afrique de l’Ouest et n’étaient pas disponibles chez Caio jusqu’à ce que, couplé avec le fait que le patient ne connaissait pas son statut VIH, semblent indiquer que le patient de l’index n’avait jamais reçu antirétroviraux En outre, les réponses aux questions sur l’utilisation des antirétroviraux suggèrent que le patient n’avait pas d’antirétroviraux antérieurs asthme. De plus, l’éloignement de Caio et l’absence des besoins les plus élémentaires dans la communauté militent contre une utilisation antirétrovirale possible. , étant donné que l’utilisation d’antirétroviraux individuels et non autorisés est connue dans certains pays africains Indépendamment de la présence d’une mutation multi-NRTI chez un patient initiant un traitement, qu’il s’agisse d’une exposition préalable à un médicament ou de la transmission d’un virus pharmacorésistant , est un problème de santé publique majeur Cette constatation en Afrique de l ‘Ouest, où il existe une grande population de personnes infectées par le VIH Les personnes qui ont peu d’options de traitement offrent un soutien solide pour l’utilisation systématique de tests de résistance génotypique pour les nouveaux patients qui commencent le traitement, pour optimiser le traitement de première ligne et permettre un traitement plus efficace.

Remerciements

Nous remercions tout particulièrement le Dr Andrew Wilkins, le Dr Dominique Ricard et Margaret Buckner pour avoir créé la cohorte Caio. Nous remercions la population de Caio, en Guinée Bissau, d’avoir participé à cette étude; l’équipe d’assistants de terrain de Caio; Nous remercions Matthew Cotton, Chris Parry et Deenan Pillay pour leur critique du manuscrit. a été soutenu par un Institut de Médecine tropicale / Direction générale belge de la Coopération au Développement bourse de doctorat de l’Institut de Médecine Tropicale d’Anvers, Belgique Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: pas de conflits