Facteurs affectant les données de surveillance sur les infections à Escherichia coli O recueillies auprès des sites FoodNet, –

Pour déterminer le fardeau de la maladie causée par les infections à Escherichia coli O dans les zones de surveillance FoodNet du Réseau de surveillance active des maladies d’origine alimentaire, nous avons initié des laboratoires de surveillance et d’enquête actifs en laboratoire, des médecins et le grand public sur les facteurs associés au diagnostic. Surveillance de l’infection par E kamagra. coli O Nous avons évalué les réponses au sondage et l’incidence spécifique au site, la flambée et les données démographiques pendant – Un total de cas confirmés en laboratoire d’infection à E. coli O et des éclosions ont été signalés sur les sites FoodNet originaux. Après exclusion des cas associés à une éclosion, l’incidence annuelle des infections sporadiques à E. coli O confirmées en laboratoire est demeurée relativement stable pendant -, avec un éventail de – cas /, population. les différences d’incidence résultaient en partie des différences entre les pratiques des médecins et des laboratoires. des prix et des facteurs d’exposition spécifiques au site, par exemple, vivre ou visiter des fermes

Réseau de surveillance active des maladies d’origine alimentaire FoodNet a été élaboré pour déterminer le fardeau et les sources de certaines maladies d’origine alimentaire dans certains États grâce à une surveillance active en laboratoire. FoodNet vise à évaluer les tendances de l’incidence de certains pathogènes d’origine alimentaire et à évaluer les causes possibles de changements. Escherichia coli O est une bactérie pathogène sous surveillance dans les zones de surveillance de FoodNet, également appelées «sites FoodNet». E coli O est une cause importante de diarrhée, de diarrhée sanglante et de syndrome hémolytique et urémique, et infecte des personnes par an aux États-Unis. États Nous avons résumé les années – de données de surveillance active pour E coli O collectées dans les sites FoodNet Notre objectif était de documenter les tendances de l’incidence et les caractéristiques démographiques de l’infection à E. coli O par année et d’identifier les raisons potentielles des différences spécifiques d’incidence.

Sujets et méthodes

Population étudiée FoodNet est un effort collaboratif impliquant les CDC, la Food and Drug Administration des États-Unis, le Service de la salubrité et de l’inspection des aliments du département de l’Agriculture des États-Unis et le programme CDC Emerging Infection Active, laboratoire- Une surveillance basée sur E coli O a été initiée dans les sites FoodNet: Minnesota, Oregon, comtés de Californie, comtés du Connecticut et comtés de Georgia In, la surveillance a été élargie pour inclure un total de comtés dans le Connecticut et en Géorgie. La surveillance comprenait l’ensemble des États du Connecticut, du Minnesota et de l’Oregon et des comtés sélectionnés dans les comtés de Californie, les comtés de Georgia, les comtés du Maryland et les comtés de New York. dans les comtés de Californie, les comtés du Maryland et les comtés de New York Le personnel de surveillance de chaque site a validé la des cas d’infection à E coli O confirmés par le boratoire en contactant systématiquement chaque laboratoire clinique dans leurs zones de surveillance. Nous avons mené l’étude conformément aux directives de la recherche humaine spécifiées par le département américain de la Santé et des Services humains. entrée dans le système d’information du laboratoire de santé publique CDC et compilé au CDC L’incidence annuelle pour chaque site dans les cas par, population a été calculée en utilisant le nombre annuel de cas confirmés en laboratoire par site divisé par les estimations annuelles du recensement pour le site. On a calculé les infections sporadiques à E coli O en soustrayant le nombre de cas confirmés en laboratoire et associés à une éclosion du nombre total de cas confirmés en laboratoire observés dans la zone de surveillance FoodNet. Dans cette analyse, une épidémie a été définie comme suit: infection à E. coli O confirmée dans différents ménages avec une c source d’exposition commune Le personnel du service de santé local ou étatique de chaque site a mené des enquêtes épidémiologiques individuelles. Une analyse globale des données de tous les sites FoodNet a été effectuée indépendamment du moment où les sites ont commencé une surveillance active en laboratoire. coli O infection, une analyse sous-ensemble des sites FoodNet originaux a été faite pour documenter les tendances pendant – Les données ont été analysées en utilisant le logiciel SAS, la version SASFactors affectant un diagnostic de E coliO Pour calculer les facteurs qui affectent le diagnostic de E coli O, études ont été utilisées tableau Les données comprenaient des enquêtes de laboratoire, de médecin et de population et des informations provenant de l’étude cas-témoins FoodNet E coli O

Vue de la table grandDisque de téléchargementFacteurs ayant influé sur le diagnostic de l’infection à Escherichia coli O dans les sites originaux de FoodNet, vue de table grandDisque de téléchargementFacteurs influant sur le diagnostic de l’infection à Escherichia coli O dans les sites FoodNet initiaux. = que des échantillons de selles régulièrement testés chez des résidents des sites FoodNet originaux ont été identifiés et étudiés pour déterminer les pratiques culturales en laboratoire pour E coli O et le nombre de cultures de selles réalisées durant le mois d’août pour les médecins, en janvier, avril, juillet et octobre , un échantillon aléatoire de médecins n = en soins primaires et de spécialités sélectionnées dans les sites originaux de FoodNet a été interrogé pour déterminer leurs pratiques en matière de culture de spécimens provenant de patients souffrant de diarrhée. l’incidence d’E coli O, on a demandé aux médecins Le laboratoire principal où ils ont envoyé des échantillons de selles pour la culture bactérienne et si ce laboratoire a toujours testé tous les échantillons de selles pour E coli O Seuls les médecins ayant soumis% de selles à un seul laboratoire ou à plusieurs laboratoires ayant la même pratique ont été inclus dans l’analyse. Nous avons comparé les réponses des médecins aux pratiques de laboratoire pour cultiver E. coli O avec les pratiques rapportées par les laboratoires. Pour l’enquête de population FoodNet, de mars à février, un échantillon aléatoire mensuel de ménages dans chaque site FoodNet a été étudié pour déterminer le taux de maladies diarrhéiques. La population et la proportion de personnes souffrant de diarrhée ont reçu des soins médicaux. Les ménages ont été contactés par numérotation aléatoire au moyen d’un plan d’échantillonnage qui augmente les appels dans les strates des banques téléphoniques avec une probabilité plus élevée de contacter un ménage résidentiel. Mars -April, patients avec E coli O infectio confirmé en laboratoire On a demandé aux patients s’ils avaient eu une diarrhée sanglante au cours de leur infection. Les données sur les cas non effrénés et les sujets témoins appariés selon l’âge ont été analysées.Calcul de l’incidence sporadique ajustée pour les sites originaux de FoodNet L’incidence des infections sporadiques confirmées en laboratoire. pour chaque site a été ajusté pour tenir compte des pratiques de laboratoire, de médecin et de population spécifiques au site en utilisant l’équation suivante: [A × B] / [C × D × E], où A est l’incidence non corrigée de E sporadique confirmée en laboratoire. coli O infections par site; tableau, rangée, B est le pourcentage de patients dans l’étude cas-témoin FoodNet qui ont eu une infection à E. coli O confirmée en laboratoire qui a signalé un tableau de diarrhée sanglante, rangée, C le pourcentage d’échantillons de selles cultivés dans les laboratoires du laboratoire FoodNet enquête où tous les échantillons de selles sanglantes sont cultivés pour E coli O par site; Par exemple,% des échantillons de selles cultivés en Californie ont été cultivés dans des laboratoires qui cultivent tous les échantillons de selles sanglantes pour la E coli O, rangée, D est le pourcentage de médecins qui ont commandé une culture de selles pour le dernier patient qu’ils ont vu. avait un tableau de diarrhée sanglante, ligne et E – le pourcentage de médecins par site FoodNet qui n’ont pas demandé la culture E coli O parce qu’ils supposaient à tort que leur laboratoire cultivait tous les échantillons de selles pour E coli O, tel que déterminé par le médecin et laboratoire FoodNet Tableau des enquêtes, rang Estimation du nombre total et de l’incidence des infections sporadiques, par site original de FoodNet Pour estimer l’incidence des cas sporadiques confirmés en laboratoire d’infection à E. coli O par site, les taux sporadiques ajustés ont été multipliés par des réciproques spécifiques aux maladies. Ces réciproques comprenaient la sensibilité estimée pour la culture d’échantillons de diarrhée sanglante pour E coli O sur sorbitol-MacConkey agar%, le pourcentage de f les personnes souffrant de diarrhée sanglante qui ont déclaré avoir consulté leur fournisseur de soins de santé% et un pourcentage de tous les isolats d’E. coli O confirmés par culture provenant de personnes souffrant de diarrhée sanglante et identifiés dans une série d’enquêtes sur les épidémies de cohorte% Par conséquent, pour calculer l’incidence estimée du nombre total de cas d’infection à E. coli O confirmés en laboratoire et sous-déclarés par site, l’incidence ajustée des cas confirmés en laboratoire a été divisée par% ×% ×% l’incidence ajustée spécifique des cas confirmés en laboratoire a été divisée par l’incidence estimée des cas d’infection à E. coli O confirmés par culture et sous-déclarés; ce processus a été utilisé pour estimer le pourcentage de cas détectés grâce à la surveillance de laboratoire

Résultats

Tous les sites FoodNet Pendant -, un total de cas confirmés en laboratoire d’infection à E. coli O ont été identifiés dans tous les sites FoodNet Des données démographiques et cliniques ont été rapportées annuellement pendant le tableau de la période de référence L’incidence annuelle dans tous les sites combinés dans les cas /, la population dans certains cas, le% a eu lieu chez les patientes chez les patientes, les% ont été âgées & lt; ans,% en% chez les patients,% ont été identifiés entre juin et septembre,% en%

Tableau View largeTélécharger les caractéristiques démographiques et cliniques des patients atteints d’une infection à Escherichia coli O dans tous les sites FoodNetTable View largeTélécharger les caractéristiques démographiques et cliniques des patients atteints d’infection à Escherichia coli O dans tous les sites FoodNet,% ont été hospitalisés,% à% patients ayant reçu un diagnostic de syndrome hémolytique et urémique HUS, représentant% des cas d’infection à E. coli O confirmés en laboratoire Le nombre annuel de cas de SHU rapportés sur tous les sites FoodNet était de – Seize décès ont été documentés, pour un taux de létalité de%; Au cours de l’année, des cas d’infection à E. coli O confirmés en laboratoire ont été identifiés dans les sites d’origine de FoodNet. Résultats démographiques et épidémiologiques similaires, par exemple, répartition selon l’âge et le sexe, saison d’infection, L’incidence de l’infection à E coli O confirmée en laboratoire était de: cas, population dans et cas /, population dans le tableau Quatre-vingt cas de SHU ont été rapportés dans les sites originaux de FoodNet , qui représentait% du nombre total de cas confirmés par culture déclarés Parmi les infections confirmées en laboratoire,% ont entraîné une hospitalisation; cas% ont été fatals

Tableau View largeTélécharger les caractéristiques démographiques et cliniques des patients infectés par Escherichia coli O dans les sites originaux de FoodNetTable View largeTélécharger les caractéristiques démographiques et cliniques des patients atteints d’infection à Escherichia coli O dans les sites FoodNet d’origine Une certaine variabilité annuelle a été observée pour le pourcentage de patients âgés. ans et le pourcentage de patients qui ont été hospitalisés pendant -, le pourcentage de patients âgés de & lt; années a augmenté de% à%, mais le taux a diminué de manière significative, de, à% P & lt; , χ = Pendant -, le pourcentage de patients hospitalisés était de% -% Pendant -, l’incidence annuelle moyenne des infections confirmées en laboratoire variait considérablement selon le site: par cas /, population en Géorgie, en Californie, au Connecticut, En Oregon, et au Minnesota Au cours de la période d’étude, l’incidence en Géorgie était de: cas / population / année; l’incidence en Californie était – cas /, population, l’incidence dans le Connecticut était -, l’incidence dans le Minnesota était -, et l’incidence dans l’Oregon était –

Figure View largeTélécharger la lameIncidence d’infections à Escherichia coli O: H confirmées en laboratoire par le site FoodNet, -Figure View largeDownload slideIncidence d’infections à Escherichia coli O: H confirmées en laboratoire par le site FoodNet, – Incidence sporadique dans les sites FoodNet initiaux Un total de laboratoire confirmé des cas d’infection à E. coli O associés à des éclosions ont été signalés dans les sites d’origine de FoodNet. Ces cas représentaient% des cas confirmés en laboratoire signalés et des éclosions signalées respectivement en Californie. Les nombres les plus faibles d’éclosions d’E. , Connecticut n =, et Géorgie n = Après avoir exclu les cas associés à une éclosion, l’incidence annuelle moyenne des cas sporadiques confirmés en laboratoire pour les sites FoodNet combinés était de – cas /, tableau de population L’incidence des cas sporadiques confirmés en laboratoire était / Facteurs affectant le diagnostic de E. coliO Ce qui suit est un vue des résultats des précédentes études FoodNet utilisées pour calculer les facteurs affectant le diagnostic d’E coli O Le pourcentage de patients ayant une infection à E. coli O confirmée en laboratoire qui a signalé une diarrhée sanglante dans l’étude cas-témoin FoodNet était de% -% par table de site Le pourcentage d’échantillons de selles cultivées pour E coli O dans les laboratoires qui cultivaient tous les échantillons de selles sanglantes pour E coli O selon l’étude de laboratoire variait nettement selon le site, du% des échantillons de selles en Géorgie au% des selles échantillons dans le Connecticut Beaucoup moins de variabilité a été notée dans les pratiques des médecins, avec% -% des médecins dans l’enquête des médecins déclarant qu’ils avaient obtenu un échantillon de selles pour la culture du dernier patient qu’ils ont vu qui avait la diarrhée sanglante. par site, n’a pas demandé une culture pour E coli O parce qu’ils pensaient à tort que leur laboratoire cultivait tous les échantillons de selles pour les E coli. L’incidence sporadique non déclarée de cas confirmés en laboratoire variait de cas /, population en Géorgie à Minnesota, un tableau de différence de nombre de cas L’incidence sporadique ajustée de cas confirmés en laboratoire a été utilisée pour ajuster l’incidence sporadique d’infections confirmées en laboratoire. Dans ces régions, les différences entre les laboratoires et les médecins représentaient un peu plus de la moitié de la variabilité de l’incidence entre les sites. Pour estimer le nombre total et l’incidence des infections sporadiques E coli O, l’incidence sporadique ajustée des cas confirmés en laboratoire a été encore ajustée par des facteurs spécifiques à la maladie Ajustement pour la réciprocité spécifique de la maladie la sensibilité estimée de la culture E coli O, le pourcentage de personnes souffrant de diarrhée sanglante prestataire de soins, et le pourcentage estimé de patients atteints d’une infection à E. coli O ayant eu une diarrhée sanglante, le incidence estimée des infections sporadiques totales E coli O par site était cas /, population en Géorgie, cas /, population en Californie, cas /, population dans le Connecticut, cas /, population en Oregon, et cas /, population au Minnesota Par exemple, le pourcentage estimé des infections sporadiques à E coli O confirmées en laboratoire et confirmées dans les sites de surveillance FoodNet était%. en Géorgie,% en Californie,% au Connecticut,% en Oregon et% au Minnesota

Discussion

E. coli O, qui indique la nécessité d’une communication plus claire entre les médecins et le personnel de laboratoire Les laboratoires sont encouragés à identifier quels organismes ont été testés lorsqu’ils rapportent des résultats négatifs de culture de selles bactériennes aux médecins; De même, les médecins doivent vérifier quels sont les organismes testés par les laboratoires. Les pratiques des médecins concernant les demandes de culture de selles sont dictées par la présentation, l’histoire et la durée de la maladie. avec des selles sanglantes, un diagnostic de sida, diarrhée durable & gt; Une étude similaire sur les pratiques des médecins dans certains services d’urgence a révélé que les médecins étaient plus susceptibles de demander la culture d’échantillons de selles à des patients fébriles ou à ceux qui avaient du sang visible dans leurs selles . influencer la détermination des cas d’infection à E. coli O, y compris la probabilité que ce patient consulte un médecin, la proportion de patients pour lesquels un test de laboratoire approprié est demandé, la capacité du processus de test à confirmer les cas et On a estimé que, pour chaque cas d’infection à E. coli O confirmé en laboratoire, un autre cas – les cas symptomatiques sont probablement omis par les systèmes de surveillance actuels. Nous avons constaté que les taux spécifiques de cas symptomatiques par cas étaient au Minnesota et au Minnesota. en Géorgie Cependant, ces estimations spécifiques au site doivent être interprétées avec prudence, car certains médecins et La variabilité des taux d’incidence entre les sites pourrait également s’expliquer par d’autres facteurs propres au site. Le Minnesota et l’Oregon présentaient l’incidence annuelle moyenne la plus élevée d’infections sporadiques confirmées en laboratoire. Les enquêtes sur les éclosions d’infection à E. coli O ont toujours associé la maladie à la consommation de boeuf haché, de laitue, de germes, de cidre de pommes, de lait cru, de viande de cerf et d’eau; le contact direct avec les animaux de la ferme; Les aliments d’origine bovine sont couramment impliqués comme sources d’infection à E. coli O, et des études récentes ont montré une forte prévalence de E. coli O chez les bovins E coli O a été observé chez% des veaux de boucherie dans les troupeaux du Midwest , et, dans une autre étude, E coli O a été trouvé dans les fèces de% des bovins à l’abattage dans une usine de transformation du Midwest. L’étude cas-témoin E coli O a identifié plusieurs facteurs de risque associés à l’infection à E coli O , notamment la consommation d’hamburger rose, d’hamburger mal cuit, la consommation de bœuf haché ou d’hamburger privé, et la consommation ou la visite d’une ferme. Le bœuf haché ou l’hamburger et l’exposition à la ferme, abattus à des fins privées, reflètent les expositions rurales plus caractéristiques des sites FoodNet du Minnesota et de l’Oregon. L’USDA, le Service national de la statistique agricole, le respectivement, dans les zones de surveillance du Minnesota et de l’Oregon ; Par conséquent, certaines des différences observées dans l’incidence des infections à E. coli O sporadiques confirmées en laboratoire entre les sites FoodNet peuvent être associées à une augmentation de la fréquence des infections à E. coli O confirmées en laboratoire. Cette association écologique entre les populations de bovins et l’incidence de l’infection à E. coli O spécifique au site doit être davantage caractérisée. En résumé, l’incidence de l’infection à E. coli O confirmée en laboratoire reste sporadique. relativement stable pendant – parmi les sites originaux de FoodNet Une variabilité régionale marquée de l’incidence a été observée entre les sites. L’incidence plus élevée au Minnesota et en Oregon résulte probablement d’une combinaison de pratiques de laboratoire et de laboratoire spécifiques au site. continuer à être éduqués sur les risques pour la santé associés à t Les installations de transformation de la viande devraient être encouragées à utiliser des technologies de pasteurisation terminale, par exemple l’irradiation des aliments pour réduire la contamination des produits finis. D’autres mesures, au-delà des pratiques actuelles, doivent être mises en œuvre pour réduire le taux d’infection par E. coli O chez les bovins. et, en fin de compte, la contamination dans l’installation de traitement. Comme l’illustrent les récentes éclosions d’infections à E. coli O associées aux visites à la ferme, des efforts supplémentaires sont nécessaires pour réduire la transmission des animaux de ferme aux enfants. réduire l’incidence de l’infection à E. coli O

Membres du groupe de travail Foodnet

CDC: Frederick Angulo, Timothy Barrett, Michael Beach, Nancy Bean, Thomas Boyce, Laura Conn, Vance Dietz, Mary Evans, Cindy Friedman, Kate Glynn, Patricia Griffin, John Hatmaker, Peggy Hayes, Debra Helfrick, Thomas Hennessy, Mike Hoekstra, Lori Hutwagner, Beth Imhoff, Malinda Kennedy, Deborah Levy, Bill MacKenzie, Kathleen Maloney, Nina Marano, Paul Mead, Thomas Navin, Sarah Pichette, Robert Pinner, Sudha Reddy, Laurence Slutsker, Karen Stamey, Bala Swaminathan, David Swerdlow Robert Ratee, Thomas Van Gilder, Drew Voetsch, David Wallace, Stephanie Wong et Samantha Yang Rowe Californie: Sharon Abbott, Felicia Chi, Pam Daily, Marianne David, Mary Ann Davis, Lisa Gelling, Alexander McNees, Janet Mohle-Boetani, Nanteeni Mukerjee, Jan O’Connell, Judy Rees, Kevin Reilly, Art Reingold, Gretchen Rothrock, Michael Samuel, Sue Shallow, Ben Silk, Duc Vugia, Stephen Waterman et Ben Werner Connecticut: Gary Budnick, Matthew Cartter, Terry Fiorentino, James Hadler, Robert Howard, Gazala Kazi, Aristea Kinney, Ruthanne Marcus, Donald Mayo, Patricia Mshar, Randall Nelson, Quyen Phan, Robin Ryder et Charles Welles Géorgie: Sabrina Burden, Molly Bardsley, Wendy Baughman, Paul Blake, Shama Desai, Monica Farley, Katherine Gibbs-McCombs, Laura Gilbert, Jane Koehler, Mina Pattani, Susan Ray, Matthew Sattah, Suzanne Segler, Kathleen Toomey et Sabrina Whitfield Maryland: Bernadette Albanese, Lillian Billman, Alicia Bustamante, Amy Carnahan, Michael Carter, Marcia Criscio, Yvonne Deane-Hibbert, Diane Dwyer, Lora Gay, Althea Glenn, Charmaine Gregg, Lee Harrison, Kelly Henning, Yvonne Hibbert, Kim Holmes, Jackie Hunter, Judith Johnson, Tobi Karchmer, Melissa Kent, J Glenn Morris Jr, Lola Olabode, Peggy Pass , Jafar Razeq, Jeffery Roche, Dale Rohn, Christine St Ours, Christian Steiner, Alexandre Sulakvelidze, Frances Yarber et Yongyu Wang Minnesota: Jeff Bender, John Besser, Richard Danila, Valerie Deneen, Craig Hedberg, Julie Hogan, Heidi Kassenborg, Car David Osterholm, Kirk Smith, Dana Soderlund et Julie Wicklund New York: Bridget Anderson, Dianna Bopp, Hwa-Gan Chang, Kathy Carlton, Barbara Damaske, Nellie Dumas, Marie Fitzgerald, Karim Hechemy, Jonathan Hibbs, Julia Kiehlbauch, Dale Morse, Candace Noonan, Brian Sauders, Perry Smith, Nancy Spina, Cathy Stone et Shelley Zansky Orégon: Vijay Balan, Chris Biggs, Maureen Cassidy, Paul Cieslak, Emilio DeBess, David Fleming, Bill Keene, Stephen Ladd-Wilson, Lore Lee, Eileen Lorber, Steve Mauvais, Teresa McGivern, Beletshachew Shiferaw, Bob Sokolow, Regina Stanton et John Townes Tennessee: Brenda Barnes, Effie Boothe, Allen Craig, Diane Eigsti Gerber, Timothy Jones, William Moore, William Schaffner et Pat Turri Département de l’agriculture des États-Unis, Service d’inspection de la sécurité sanitaire des aliments: Arthur Baker, Ruth Etzel, Jill Hollingsworth, Peggy Nunnery, Phyllis Sparling et Kaye Wachsmuth Administration américaine des aliments et des médicaments, Centre de la sécurité alimentaire et de la nutrition appliquée: Sean Alterkruse, Ken Fa lci, Bing Garthright, Janice Oliver et Clifford Purdy