Infection invasive par Salmonella enterica multirésistante sérotype Typhimurium type définitif chez les adultes infectés par le VIH

Contexte Le MRDT de type définitif de Typhimurium à sérotype multirésistant de Salmonella enterica, résistant au moins à l’ampicilline, au chloramphénicol, à la streptomycine, au sulfaméthoxazole et à l’ACSSuT de type t de tétracycline, a été détecté pour la première fois aux États-Unis. Méthodes Une étude rétrospective des infections à S Typhimurium dans un système de santé urbain a permis de déterminer si une infection par une souche résistante aux antibiotiques, et plus particulièrement le MRDT, était associée à une infection invasive ou à une infection par le VIH Soixante cas d’infection par Typhimurium ont été identifiésRésultats Parmi les isolats disponibles pour analyse,% étaient MRDT Des pathogènes ont été isolés du sang chez% des patients infectés par MRDT, comparé à% des patients infectés par des souches non-MRDT P = Parmi isolats obtenus à partir de patients infectés par VIH,% des isolats de MRDT provenaient d’échantillons de sang, comparés à% d’isolats de non-MRDT P = Conclusions Le TDDT représentait la majorité des infections à S. Typhimurium dans cette population de patients, et les infections à MRDT étaient plus invasives que les infections non-MRDT, en particulier chez les personnes infectées par le VIH.

Chaque année, environ un million de personnes sont infectées par Salmonella aux États-Unis La plupart des infections entraînent une gastro-entérite légère à modérée, mais des infections graves peuvent survenir, entraînant bactériémie, méningite et mort. et les décès chaque année Depuis le début, une moyenne annuelle d’infections à Salmonella confirmées par culture a été signalée au CDC des Centers for Disease Control and Prevention; Atlanta, GA , dont% sont survenus chez des personnes de CD ans CDC; Dans le réseau FoodNet de surveillance active des maladies d’origine alimentaire du CDC, des sérotypes de Salmonella ont été isolés à partir d’échantillons de sang ou de liquide céphalorachidien de% des personnes de ⩾ ans ayant eu une infection à Salmonella confirmée par culture au cours de – FoodNet ; données non publiées; % de personnes de ⩾ ans avec une infection à Salmonella confirmée par culture mortSalmonella enterica sérotype Typhimurium était le sérotype le plus fréquemment identifié parmi les infections confirmées par culture déclarées aux CDC pendant -, représentant% des infections rapportées Ces dernières années, la résistance aux antimicrobiens La surveillance nationale de la résistance aux antimicrobiens chez les souches de Salmonella aux États-Unis est réalisée par le biais du Système national de surveillance de la résistance aux antimicrobiens des bactéries entériques Typhimurium type MRDT résistant aux antibiotiques de type définitif, résistante au moins à l’ampicilline, au chloramphénicol, à la streptomycine, au sulfaméthoxazole et à l’ACSSuT de tétracycline de type R, a été détectée pour la première fois aux États-Unis et est devenue la souche multirésistante la plus courante de Salmonella aux États-Unis et plusieurs autres Au milieu de l’année En,% de S Typhimurium les isolats étaient ACSSuT; de ces isolats,% étaient de type définitif Par conséquent,% des infections humaines de Salmonella aux Etats-Unis étaient dues à MRDT Des éclosions d’infection MRDT aux États-Unis ont été associées à l’exposition aux bovins et à la consommation de produits laitiers L’utilisation préalable d’agents antimicrobiens pour le traitement d’une autre maladie a également été associée à une infection sporadique à TDDT . L’infection à MRDT a été associée à une sévérité accrue de l’infection, y compris un taux accru de létalité au Royaume-Uni. des études aux États-Unis et au Danemark, l’infection MRDT a également été associée à des taux accrus d’hospitalisation et une mortalité accrue Les personnes infectées par le VIH représentent une population de patients à risque accru de salmonellose invasive, récidivante et surtout pharmacorésistante. infections Ni l’association entre l’infection par le VIH et l’infection subséquente par le MRDT, ni les conséquences cliniques de l’infection par le MRDT chez les personnes infectées par le VIH. À notre connaissance, une étude rétrospective des infections à S. Typhimurium chez des patients adultes consécutifs dans un centre médical urbain a été menée pour déterminer si l’infection par des souches résistantes aux antibiotiques, en particulier le MRDT, était associée à une maladie invasive et si L’infection par le VIH était associée à une infection due au TDDT, par rapport à une infection due à d’autres souches de S Typhimurium

Matériaux et méthodes

Depuis octobre Tous les adultes définis comme des personnes de ⩾ ans avec S Typhimurium confirmé par culture et isolé au laboratoire GMH pendant une période d’octobre à décembre ont été inclus dans l’étude; L’âge limite des années a été choisi pour inclure les adultes les plus susceptibles d’être sexuellement actifs et donc à risque d’infection par le VIH. Si S Typhimurium a été isolé à partir de & gt; spécimen c.-à-d. isolé des échantillons de sang et de selles d’un seul patient, seul l’isolat de sang a été pris en compte dans l’analyse Si des isolats provenant du même site ont été obtenus sur & gt; Examen des dossiers médicaux Examen des dossiers médicaux, pharmaceutiques et de laboratoire des patients Les données extraites des dossiers médicaux des patients comprenaient les sources de spécimens ayant produit S Typhimurium, l’utilisation d’agents antimicrobiens chez les patients. le mois avant l’isolement de S Typhimurium, cours de traitement et résultat patient Les dossiers de laboratoire informatisés ont également été examinés pour les résultats des tests sérologiques pour le VIH et, parmi les patients infectés par le VIH, les numérations cellulaires CD déterminées par cytométrie en flux et charge VIH. par RT-PCR On a considéré que l’infection par le VIH était confirmée s’il y avait un résultat ELISA documenté positif pour le VIH qui a été confirmé par Western blot; les patients avec un résultat ELISA négatif pour le VIH dans l’année après l’infection par S Typhimurium étaient considérés non infectés par le VIH Pour les patients sans résultat de test VIH, un suivi mensuel des dossiers patients et le registre confidentiel du VIH maintenu par le laboratoire GMH Pour les besoins de l’analyse, les patients sans résultat du test VIH ont été considérés comme non infectés par le VIH. Les dossiers informatisés des pharmacies et les dossiers hospitaliers ont été examinés pour déterminer l’historique d’utilisation. des agents antimicrobiens La récurrence de toute infection par Salmonella a été définie comme un isolement subséquent de S Typhimurium après l’achèvement d’un traitement antibiotique en ambulatoire ou en ambulatoire après l’isolement initial de S Typhimurium. Décès dans les jours suivant le prélèvement des échantillons dans les calculs de létalitéAnalyse microbiologique Tous les selles et sp Les échantillons qui ont été soumis au laboratoire GMH ont été cultivés pour Salmonella en utilisant des méthodes standard Des isolats ont été initialement cultivés sur du xylose-lactose-désoxycholate et de la gélose Hektoen-entérique et un milieu de bouillon enrichi en sélénite; Après l’incubation, les colonies typiques ont été prélevées et repiquées dans le système de tubes Rollender et Beckford Remel pour identification Les isolats de Salmonella ont été sérotypés au Georgia State Public Health Laboratory selon le schéma de Kauffman et White Les isolats de Salmonella identifiés au laboratoire GMH de De décembre à décembre ont été conservés à – ° C avant l’analyse microbiologique. Des tests de résistance aux antimicrobiens ont été effectués au CDC avec le système de microdilution Sensititre en milieu liquide. Trek Diagnostics Au CDC, les CMI partiels des agents antimicrobiens ont été déterminés selon les normes NCCLS. ampicilline, tétracycline, triméthoprime-sulfaméthoxazole, ciprofloxacine, amikacine, amoxicilline / acide clavulanique, céphalothine, chloramphénicol, gentamicine, kanamycine, acide nalidixique, streptomycine, sulfaméthoxazole et ceftriaxone La résistance a été déterminée selon les normes interprétatives NCCLS. Isolats de Salmonella w Les phages sont dactylographiés au CDC selon le système international de typage des phages Les isolats classés comme types DT, DTa, DTb ou U définitifs sont considérés comme étroitement apparentés et sont classés comme DT complexes; ils seront appelés ci-après «isolats DT». Les isolats autres que les isolats DT comprennent ceux qui réagissent aux phages mais ne se conforment pas à un type de phage spécifique communément appelé isolats non typables et non typables [RDNC] dans cette analyse, L’analyse MRDTPFGE a été réalisée au Laboratoire de Maladies Infectieuses de l’Université Emory d’Atlanta et au Laboratoire de Santé Publique de l’Etat de Géorgie à Atlanta en utilisant le protocole de laboratoire standardisé pour le sous-typage moléculaire des pathogènes bactériens d’origine alimentaire par PFGE Gel. les images ont été comparées en utilisant le coefficient de Dice et la méthode des groupes de paires non pondérées avec le logiciel Molecular Analyst Fingerprinting Plus pour Windows, version BioRad Laboratories, au CDC. Les critères de Tenover pour la parenté ont été utilisés; les isolats avec une différence de bande were ont été considérés comme ayant le même profil PFGE Analyse des données Le test exact de Fisher ou le test was a été utilisé pour comparer les variables catégorielles; Valeurs P & lt; ont été considérés comme statistiquement significatifs. Les variables continues distribuées de façon non normalisée ont été comparées à l’aide du test de la somme des rangs de Wilcoxon. L’analyse des données a été effectuée en utilisant le logiciel EpiInfo, version CDC.

Résultats

Pendant les mois de la période d’étude, le laboratoire de GMH a identifié des cas de Salmonella confirmés par culture. Parmi les isolats associés à ces cas,% provenaient d’adultes, à savoir, des personnes de ⩾ ans, ont été sérotypés et% S Typhimurium. Les isolats de Salmonella qui étaient S Typhimurium étaient% de,% de,% de,% de, et% de Dans les facteurs cliniques et l’infection par le VIH Parmi les adultes ayant une infection à S. Typhimurium confirmée par culture,% ont été hospitalisés unité de soins S Typhimurium a été isolé à partir de prélèvements sanguins chez% des patients, échantillons de selles chez% des patients, échantillons d’urine chez% des patients et échantillons de sang et de selles chez% des patients. ; les patients% avaient une infection à VIH confirmée Le test VIH n’a pas été réalisé pour les patients; Le suivi des dossiers médicaux de ces patients a révélé qu’aucun de ces patients n’avait reçu plus tard un diagnostic d’infection par le VIH. Cinq% des patients avaient une infection récurrente à T. Typhimurium. Onze patients étaient décédés quelques jours après le prélèvement des échantillons. Une quinzaine de patients ont reçu des agents antimicrobiens dans le mois qui a précédé le début de l’infection à Salmonella. La relation entre l’infection par le VIH et les paramètres démographiques et cliniques des patients atteints d’une infection à S. Typhimurium a été déterminée pour les patients infectés par le VIH et infectés par S Typhimurium dans les mois précédant l’apparition de la maladie; Le nombre de cellules CD variait entre cellules / μL nombre de cellules CD médian, cellules / μL charges virales, qui étaient disponibles pour les patients infectés par le VIH avec une infection à S Typhimurium dans les mois précédant le début de la maladie, allant de, à> copies / mL

Tableau View largeTélécharger les caractéristiques démographiques et cliniques des adultes présentant une infection à Salmonella enterica sérotype Typhimurium à l’Hôpital Grady Memorial, octobre-décembre, selon le statut de l’infection par le VIHTable View largeTélécharger les caractéristiques démographiques et cliniques des adultes présentant une infection à Salmonella enterica sérotype Typhimurium à l’Hôpital Grady Memorial, octobre -Décembre, par statut d’infection par le VIH Nombre de cellules CD corrélé avec le résultat Les cellules CD / cellules médianes / μL ont un nombre de cellules CD médian inférieur à celles des patients ayant survécu au nombre médian de cellules CD, cellules / μL; P = De même, parmi les patients infectés par le VIH avec infection à Typhimurium S ayant un nombre de cellules CD déterminé et survécu, les patients ayant développé une infection récurrente avaient un nombre de cellules CD médian inférieur au nombre de cellules CD médian, cellules / μL que les patients sans récidive nombre de cellules CD médian, cellules / μL; P = Analyse microbiologique Des isolats étaient disponibles pour l’analyse microbiologique chez% des patients infectés par S. Typhimurium Les patients pour lesquels les isolats étaient disponibles ne différaient pas significativement des patients pour lesquels les isolats n’étaient pas disponibles en termes de taux d’hospitalisation, de bactériémie, d’infection VIH Données sur les isolats de S Typhimurium disponibles,% des isolats étaient résistants à l’ampicilline,% à la streptomycine,% au sulfaméthoxazole,% à la tétracycline,% au chloramphénicol,% à la kanamycine,% à la gentamicine et% au triméthoprime % des isolats étaient pansusceptibles; isoler% était résistant à l’agent antimicrobien,% aux agents antimicrobiens, aucun aux agents antimicrobiens,% aux agents antimicrobiens,% aux agents antimicrobiens et% aux agents antimicrobiens; par conséquent,% de ces isolats étaient résistants aux ⩾ agents antimicrobiens. ACSSuT de type R a été observé dans les isolats; Un ACSSuT de type R avec une résistance supplémentaire à l’ACKSSuT de type R de la kanamycine a été observé dans des isolats; Un ACSSuT de type R avec une résistance supplémentaire à l’ACSSuTTm de type R de triméthoprime a été observé dans un isolat; résistance à l’ampicilline, à la kanamycine, à la streptomycine, au sulfaméthoxazole et à la tétracycline AKSSuT de type R a été observée dans les isolats Tous les isolats conservés sensibles aux quinolones et aux céphalosporines à spectre étendu Typage des phages et PFGE des isolats Tous les isolats S Typhimurium disponibles ont été typés et sous-typés par PFGE Trente-quatre pour cent des isolats appartenaient au complexe DT; étaient DTa, étaient DTb, étaient DT, et étaient U Des isolats de complexe DT, étaient pansusceptibles, étaient ACSSuT de type R, et isolat chacun était ACSSuTTm de type R, ACKSSuT de type R, ASSuT de type R, et résistant à l’ampicilline et le sulfaméthoxazole de type R ASu Par conséquent,% des isolats de S Typhimurium étaient MRDT Tous les isolats ont été sous-typés par PFGE Quatre motifs PFGE A, C, D et E étaient partagés par & gt; isolat Ces patrons représentaient% des isolats. Trente et un isolats% étaient des motifs A Tous les isolats de type A appartenaient au complexe DT; % d’isolats de MRDT étaient de type A

Tableau View largeTélécharger Diapositive type, schéma PFGE et sensibilité aux antibiotiques des isolats de Salmonella enterica sérotype Typhimurium, octobre à décembre Tableau View largeTélécharger Diapositive Type de type, profil PFGE et susceptibilité aux antibiotiques des isolats de Salmonella enterica sérotype Typhimurium, octobre à décembre La proportion d’isolats de S Typhimurium qui étaient MRDT pour chaque année au cours de la période d’étude était% of,% of in,% of in,% of in et% of in Bacteremia Des isolats de S Typhimurium,% ont été isolés à partir d’échantillons de sang Patients avec S Typhimurium Les isolats de MRDT étaient plus susceptibles que les autres patients d’être bactériémiques; les isolats obtenus à partir de% de patients avec infections MRDT provenaient d’échantillons sanguins, comparés à% d’isolats non-MRDT P = Sept% d’isolats pansusceptibles provenaient d’échantillons de sang, et% d’isolats de S Typhimurium avec résistance à & gt; Vingt-trois pour cent des patients avec des isolats disponibles ont été infectés par le VIH Vingt pour cent des patients avec des isolats de S Typhimurium MRDT ont été infectés par le VIH, comparé à% des patients avec non-MRDT Salmonella P = Neuf% Parmi les isolats obtenus à partir des patients infectés par le VIH,% des isolats de MRDT provenaient d’échantillons de sang, comparé à% d’autres isolats P = Parmi les isolats obtenus chez les patients non infectés par le VIH,% d’isolats de MRDT étaient à partir d’échantillons de sang, comparé à% d’autres isolats P =; stratifiés P = Résultats Parmi les patients avec des isolats S Typhimurium disponibles,% ont été hospitalisés Les taux d’hospitalisation étaient similaires chez les patients avec des isolats de phénotypes variés:% des patients avec des isolats S Typhimurium MRDT ont été hospitalisés, comparé à% des autres isolats P = Huit % des patients avec des isolats pansusceptibles ont été hospitalisés Les taux d’hospitalisation étaient similaires même lorsque les données d’hospitalisation étaient stratifiées par les données d’infection sanguine non montrées des patients nécessitant l’admission à l’unité de soins intensifs,% d’isolats de MRDT avec les isolats disponibles:% de patients avec MRDT sont morts, comparé avec% d’autres infections P = Deux% des patients avec infections pansusceptibles sont mortsSi les patients qui ont développé une infection récurrente, tous étaient infectés par le VIH, et ont été infectés par MRDT Tous les patients semblaient expérience rechute avec le même organisme qui a causé la première infection, car les profils PFGE et les susceptibilités aux antibiotiques des isolats des épisodes initiaux et récurrents étaient identiques sauf pour le développement d’une susceptibilité intermédiaire à l’amoxicilline-clavulanate MIC, μg / mL et résistance à la céphalothine chez les patients présentant des récidives d’infection. isolats,% ont reçu un agent antimicrobien au cours du mois précédant l’apparition de la maladie Les patients atteints de MRDT [%] n’étaient pas plus susceptibles de recevoir un agent antimicrobien avant l’apparition de la maladie que les patients avec isolats pansusceptibles [%]; P = La personne ayant un isolat ACSSuTTm de type R résistant à la triméthoprime était infectée par le VIH et avait reçu du triméthoprime-sulfaméthoxazole pour la prophylaxie de la pneumonie à Pneumocystis jiroveci antérieurement à Pneumocystis carinii le mois précédant le début de la maladie.

Discussion

À notre connaissance, il s’agit du premier rapport évaluant la résistance aux médicaments du Typhimurium S et son association avec les paramètres cliniques dans une population présentant des taux relativement élevés d’infection à VIH Nous avons observé que le Typhimurium MRDT causait une proportion élevée de cas de salmonellose dans notre population; % d’isolats de Salmonella étaient S Typhimurium, et% d’entre eux étaient MRDT Par contre, dans la surveillance nationale menée, un pourcentage estimé d’isolats de Salmonella était MRDT Parmi les patients infectés par S Typhimurium, les infections MRDT étaient plus susceptibles d’être invasives que Infections non-MRDT S Typhimurium, en particulier chez les personnes infectées par le VIH Une prévalence plus élevée d’infections à Salmonella et des taux accrus de bactériémie et de rechute ont été notés précédemment chez les personnes infectées par le VIH, conduisant à l’inclusion de Salmonella septicémie comme maladie indicatrice du SIDA tadacippharmacy.com. Bien que les isolats de MRDT ne soient pas plus fréquents chez les patients infectés par le VIH avec S Typhimurium que chez les patients avec S Typhimurium non infectés par le VIH, les souches MRDT étaient plus susceptibles que les autres souches S Typhimurium d’être isolées des échantillons de sang. effet global largement attribué à l’augmentation de l’invasivité chez les personnes infectées par le VIH Parmi les personnes infectées par le VIH dans notre étude,% d’isolat de MRDT P = Malgré une diminution du caractère invasif du MRDT dans les modèles animaux , plusieurs études cliniques ont trouvé une augmentation de la mortalité et des signes d’augmentation de la morbidité chez les patients atteints d’une infection à S. Typhimurium résistante aux médicaments [- ] Une étude cas-témoin a montré des taux d’hospitalisation accrus et une augmentation du taux de mortalité associée à l’infection DT, comparativement à l’infection par d’autres souches de Salmonella . Notre étude n’a toutefois pas trouvé de mortalité accrue associée à l’infection DT. malgré la détection d’un envahissement accru associé à une infection par MRDT bien que la mortalité globale soit supérieure aux taux nationaux associés à l’infection à T. Typhimurium Toutes les récidives d’infection dans notre étude ont eu lieu chez des personnes infectées par le VIH. déterminé qu’il s’agissait de rechutes plutôt que de nouvelles infections. Un risque accru de récidive La prévalence élevée de MRDT parmi les isolats de S Typhimurium dans cette étude a contribué au fait qu’une proportion élevée d’isolats% a été obtenue à partir de prélèvements sanguins. En revanche, dans les données de surveillance nationale de, seulement% de S Typhimurium les isolats provenaient d’échantillons de sang CDC; données non publiées L’écart entre les taux de bactériémie retrouvés dans cette étude et ceux observés dans les données de surveillance nationale peut être dû en partie au cadre de notre étude: un système municipal de soins de santé important, dans lequel les patients ont tendance à se présenter plus tard. Au cours de cette étude, l’utilisation antérieure d’antibiotiques par les patients était fréquente: un quart de tous les cas et Un tiers des patients infectés par le VIH ont reçu des antibiotiques soit en prophylaxie soit en traitement d’autres processus avant l’apparition de la maladie. Cependant, chez les patients infectés par S Typhimurium, l’utilisation préalable d’antibiotiques n’était pas un facteur de risque d’infection par Typhimurium multirésistant. la résistance était fréquente chez les isolats de S Typhimurium dans cette étude, tous les isolats ont conservé leur sensibilité aux quinolones et aux céphalosporines à spectre étendu, la plus Dans notre étude, nous avons trouvé que l’infection par S Typhimurium MRDT était plus invasive que l’infection due à d’autres souches de S Typhimurium, en particulier chez les personnes infectées par le VIH Le taux élevé d’infection par MRDT S Typhimurium dans cette étude. la population et l’augmentation apparente du pouvoir envahissant de ces infections peuvent entraîner une augmentation de la morbidité et des coûts de santé. Des études supplémentaires sont nécessaires pour déterminer les facteurs de risque épidémiologiques et les bases moléculaires de l’envahissement accru du MRDT observé chez cette population de patients.

Remerciements

Nous remercions Suzanne Segler et Shama Desai pour leur aide dans l’identification des cas de Salmonella à partir de la base de données EIP; le personnel du laboratoire de microbiologie du CDC et des laboratoires de recherche clinique de l’Université Emory sur les maladies infectieuses, pour une excellente assistance technique; Annalyn Brondyke, pour l’assistance de secrétariat; et William J Burman et C Robert Horsburgh, Jr, pour une lecture critique du manuscrit Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: aucun conflit