Un traitement par chimiothérapie chez des patients pédiatriques atteints de leucémie myéloïde aiguë recevant une prophylaxie antimicrobienne entraîne une augmentation relative de la colonisation par des bactéries potentiellement pathogènes dans l’intestin

Généralement, les humains sont protégés contre les infections par leurs microorganismes intestinaux anaérobies fournissant une résistance à la colonisation Chez les patients immunodéprimés, les pathogènes intestinaux Gram positif et Gram négatif endogènes provoquent souvent des complications infectieuses. Nous avons donc analysé l’effet de la chimiothérapie et de la prophylaxie antimicrobienne sur les populations bactériennes intestinales. Méthodes Pendant les cycles de chimiothérapie, les échantillons fécaux ont été prélevés chez des patients pédiatriques atteints de leucémie myéloïde aiguë. Les populations bactériennes fécales ont été analysées par réaction en chaîne de la polymérase. Gel dénaturant. Gel électrophorèse. Empreinte digitale. Analyse par hybridation fluorescente in situ avec des échantillons de microbiote. des sondes oligonucléotidiques bactériennes spécifiques ont été utilisées pour quantifier les bactéries fécalesRésultatsDurant le traitement de chimiothérapie, le nombre total de bactéries dans les échantillons fécaux était par gramme de poids sec les fèces, qui étaient plus faibles que dans les échantillons témoins sains, ont montré que cette diminution était le résultat d’une diminution allant jusqu’à – fois plus importante des bactéries anaérobies, en partie compensée par une multiplication des entérocoques potentiellement pathogènes. Des tests in vitro ont montré un effet bactériostatique direct des chimiothérapies. Les patients atteints de leucémie myéloïde aiguë traités par chimiothérapie et les antibiotiques prophylactiques sont incapables de maintenir la résistance à la colonisation en raison d’un effet antibactérien direct. diminution des bactéries anaérobies et augmentation des entérocoques aérobies potentiellement pathogènes Nous émettons l’hypothèse que cette perturbation de l’équilibre entre les bactéries anaérobies et aérobies augmentera encore le risque d’infections aérobies à Gram positif chez les patients immunodéprimés atteints de cancer

Infections et complications inflammatoires restent parmi les complications sérieuses les plus fréquentes des traitements de chimiothérapie chez les patients cancéreux, responsables de morbidité et de mortalité, malgré l’utilisation d’antibiotiques prophylactiques et l’utilisation empirique précoce d’antibiotiques à large spectre pour la neutropénie fébrile Pour prévenir l’invasion des bactéries endogènes de la cavité buccale et du tractus gastro-intestinal, les mécanismes de défense sont jugés pertinents: immunité innée, barrière mécanique des muqueuses et résistance à la colonisation. , on sait que les principaux paramètres de l’immunité innée sont la durée et le nadir de la neutropénie, tous deux associés à un risque accru d’infection De nos jours, l’attention est attirée sur la mucosite, causée par la chimiothérapie et la radiothérapie, en tant que facteur de risque indépendant de complications infectieuses Cet article cuses sur la résistance à la colonisation, le troisième mécanisme de défense pour la prévention de la translocation des bactéries entéropathogènes La résistance à la colonisation est l’effet bénéfique du microbiote résidant anaérobie prédominant du tractus gastro-intestinal qui, par leur nombre, résiste à l’invasion et / ou Une caractérisation adéquate du microbiote intestinal est nécessaire pour étudier la relation supposée entre la résistance à la colonisation, la mucosite, l’inflammation intestinale et l’infection. Des études antérieures ont étudié l’effet de la chimiothérapie et / ou de la chimiothérapie. antibiotiques sur le microbiote intestinal Cependant, la plupart de ces études ont été entravées par les restrictions des techniques culturales, car une grande partie des bactéries intestinales n’a jamais été cultivée et échappe ainsi à la détection. L’introduction des techniques ADN a permis d’analyser Le DGGE est une méthode dépendant de la séquence pour séparer l’ADN microbien amplifié L’empreinte résultante peut être utilisée pour analyser qualitativement et comparer des échantillons contenant une diversité de microbiote hybridation fluorescente in situ FISH avec Les changements dans le microbiote intestinal pendant le traitement de chimiothérapie pourraient influencer la résistance à la colonisation, augmentant ainsi le risque d’infection. Par conséquent, nous avons caractérisé les changements qualitatifs et quantitatifs dans le microbiote intestinal et leur utilisation dans le microbiote intestinal. causes, en utilisant des techniques basées sur l’ADN, parmi une cohorte de patients pédiatriques atteints de leucémie myéloïde aiguë, connus pour leur risque élevé d’infection et de complications gastro-intestinales

Matériaux et méthodes

Tous les patients pédiatriques consécutifs atteints d’AML diagnostiqués d’octobre à octobre ont été inclus dans cette étude, après approbation par le comité local d’éthique médicale et consentement éclairé conformément aux directives institutionnelles Tous les patients ont été traités selon le protocole de traitement AML de l’enfance néerlandaise. Oncology Group, qui est similaire au protocole UK MRC du Medical Research Council du Royaume-Uni, à savoir la cytarabine à haute dose, la daunorubicine et l’étoposide [ADE I et ADE II]; l’amsacrine, la cytarabine à haute dose et l’étoposide [MACE]; et mitoxantrone et cytarabine à haute dose [MidAC] Tous les patients ont reçu une antibioprophylaxie contre les bactéries Gram négatif et le traitement fongique avec la colistine orale, la néomycine et l’amphotéricine B ou avec la ciprofloxacine et l’itraconazol, les streptocoques du groupe viridans la phénethicilline orale et Pneumocystis jiroveci cotrimoxazol oral La neutropénie fébrile a été empiriquement traitée à la fois avec la vancomycine et la ceftazidime. On a recueilli les fèces pendant les cycles consécutifs de chimiothérapie ADE I, ADE II, MACE et MidAC; Figure Les premiers échantillons ont été collectés le troisième centile du jour, le jour suivant le début du cycle. Les derniers échantillons ont été collectés le troisième centile du jour. Un échantillon de fin de traitement a été prélevé au moins plusieurs semaines après la fin du traitement.

Figure View largeTélécharger les échantillons de patients collectés en début et en fin de traitement pendant les cycles de chimiothérapie consécutifs Les valeurs du «nombre de patients échantillonnés» reflètent le nombre de patients avec des échantillons / nombre de patients possibles ADE I, cycle de chimiothérapie I; ADE II, cycle de chimiothérapie II; MACE, cycle de chimiothérapie III; MidAC, cycle de chimiothérapie IVFigure View largeTélécharger les échantillons de patients collectés en début et en fin de traitement en fin de cycle de chimiothérapie consécutifs Les valeurs du «nombre de patients échantillonnés» reflètent le nombre de patients avec des échantillons / nombre de patients possibles. JE; ADE II, cycle de chimiothérapie II; MACE, cycle de chimiothérapie III; MidAC, cycle de chimiothérapie IVPour montrer la forte similitude intra-individuelle entre les échantillons fécaux, les échantillons d’un seul volontaire sain ont été recueillis pendant une période de mois Les résultats FISH des patients ont été comparés aux résultats FISH pour les échantillons fécaux de volontaires sains, préalablement collectés et analysés dans notre étude. Laboratoire Pour déterminer l’effet du traitement par la phénethicilline sur le microbiote intestinal, des volontaires sains ont pris de la phénethicilline à la posologie de mg deux fois par jour pendant plusieurs jours. Des échantillons fécaux ont été prélevés avant et après le traitement. chaque échantillon a été séché en utilisant un lyophilisateur Christ Alpha; Salm et Kipp pour déterminer le rapport pondéral mouillé-sec, nécessaire pour calculer le nombre de bactéries par gramme de selles de poids sec, pour compenser l’effet de dilution dû à la diarrhéeExtrait d’ADN à partir d’échantillons fécaux L’ADN a été extrait à l’aide d’un selles d’ADN mini kit Qiagen, conformément au protocole du fabricant, avec des modifications mineures Pour améliorer la lyse des bactéries Gram positif, la température a été augmentée à ° C Deuxièmement, la quantité de tampon d’élution a été réduite à μL, pour augmenter la concentration finale d’ADNPolymerase réaction PCR Pour l’amplification de l’ADN bactérien, les amorces bactériennes universelles décrites par Watanabe et al ont été utilisées Pour rendre le produit PCR éligible à la DGGE, un clamp GC précédemment décrit a été ajouté à l’amorce avant Le mélange réactionnel PCR contenait μL tampon de réaction Fermentas Life Sciences, polymérase U Taq Fermentas Life Sciences, mmol / L MgCl, nmol / L des deux amorces, μmol / L de désoxyribonucléotide triphosphate, μ L sérumalbumine bovine mg / ml; New England Biolabs, et ng d’ADN matrice en μL Le profil de température inclus min à ° C, suivi de cycles à ° C pour s, ° C pour s, et ° C pour min, suivie de min à ° C Après électrophorèse sur gel, les produits de PCR colorés au bromure d’éthidium ont été analysés par lumière ultravioletteDGEG DGGE des produits PCR a été réalisée comme décrit par Muyzer et al , en utilisant un système PhorU Ingeny Selon la concentration, – μL de produit PCR a été chargé sur un% poids / gel de polyacrylamide en volume avec un% dénaturant gradient% dénaturant est égal à mol / L urée et% formamide électrophorèse a été réalisée pour h à V à ° C gels ont été colorées avec du nitrate d’argent comme décrit ailleurs FISH échantillons fécaux ont été dilués dans le phosphate solution saline tamponnée NaCl, g KCl, g NaHPO et g KHPO, chacun par litre, en fonction de la liquidité FISH a été effectuée sur des lames de verre comme décrit ailleurs , sauf que les échantillons fixes ont été dilués dans une solution saline tamponnée au phosphate. s ont été hybridées pour h avec les sondes répertoriées dans le tableau ou pour -h dans le cas des sondes Bac et Ec Avant l’hybridation avec Enfl, Enfm et Strc, les échantillons ont été traités avec du lysozyme pour perméabiliser la paroi cellulaire, comme décrit [B] Après incubation, les lames ont été lavées, séchées à l’air et montées avec Vectashield Vector Laboratories Les bactéries ont été comptées visuellement à l’aide d’un microscope à épifluorescence Olympus BH Au moins les champs microscopiques ont été comptés ou autant de champs nécessaires pour obtenir un résultat positif. bactéries au maximum de champs Le nombre total de bactéries a été déterminé par le comptage bactérien avec la sonde universelle Eub, dénombrée avec les comptages des sondes Strc, Enfm et Enfl, car leurs espèces cibles ne s’hybrident pas avec la sonde Eub sans perméabilisation Les bactéries anaérobies obligatoires sont appelées anaérobies Les bactéries facultatives aérobies et tolérantes à l’oxygène sont appelées aérobies

Tableau View largeTélécharger les lames Sondes oligonucléotidiques utilisées pour l’hybridation in situ fluorescenteTable View largeDownload Sondes oligonucléotidiques utilisées pour l’hybridation in situ fluorescenteChemotherapeutics et croissance bactérienne Les bactéries, préalablement isolées à partir d’échantillons cliniques, ont été cultivées dans leur milieu approprié en utilisant des procédures de laboratoire standard . diluer des cultures bactériennes fois dans leur milieu correspondant. Des bactéries anaérobies ont été incubées et cultivées en utilisant un capot anaérobie Concept; Ruskinn Technology Limited Pour déterminer l’effet sur la croissance bactérienne, différentes concentrations de chimiothérapies ont été ajoutées aux milieux de culture, comme indiqué dans le tableau. Les concentrations de substances thérapeutiques ajoutées ont été déterminées sur la base des taux plasmatiques pertinents La croissance bactérienne a été quantifiée par l’augmentation de l’absorbance des échantillons à nm, déterminée après h d’incubation à ° C, avec utilisation d’un photospectromètre Vitatron Nederland, par rapport à un témoin, qui contenait le milieu de culture approprié et des bactéries mais pas d’agents chimiothérapeutiques

La sensibilité in vitro des souches bactériennes à la daunorubicine, l’étoposide et la cytarabineTable View largeDownload slideIn sensibilité in vitro des souches bactériennes à la daunorubicine, l’étoposide et la cytarabineAnalyse des données Les différences intrapatientes du nombre de bactéries à différents moments ont été comparées à l’aide du test de Wilcoxon. données appariées Des échantillons non apparentés ont été testés en utilisant le test U de Mann-Whitney, avec utilisation de SPSS, version SPSS AP valeur & lt; a été considérée comme statistiquement significative Pour l’analyse des empreintes digitales DGGE fécales, la similarité a été calculée sur la base d’un coefficient de corrélation de Pearson avec l’utilisation de Mathcompar II Applied-maths

Résultats

Sujets

Au cours des cycles de chimiothérapie, un total de prélèvements fécaux ont été prélevés chez des patients pédiatriques atteints de LAM qui ont reçu des chimiothérapies consécutives selon les critères des événements indésirables du National Cancer Institute, une lésion de la barrière muqueuse intestinale de grade I-III après% des cycles de chimiothérapie. Le taux le plus élevé de lésions de la barrière de la muqueuse intestinale a été trouvé pour le cycle de chimiothérapie I des patients et le cycle III des patients

Comparaison des empreintes digitales PCR-DGGE du microbiote intestinal

La diversité du microbiote intestinal dans les échantillons fécaux obtenus en série était sévèrement limitée dans les échantillons précoces et tardifs, par rapport à l’échantillon de fin de traitement. Figure A Chaque ligne d’un gel PCR-DGGE représente une empreinte microbienne d’un échantillon fécal; chaque bande dans une voie correspond à des espèces bactériennes, bien que différentes espèces puissent parfois être représentées par une bande A à la même hauteur dans des voies différentes est considérée comme étant la même espèce bactérienne Lors du traitement de chimiothérapie, une diminution importante de la diversité bactérienne a été observée. nouveau cours de chimiothérapie, la diversité bactérienne a été partiellement restaurée La similitude médiane entre les échantillons précoces et tardifs dans la population de patients était faible, dans la plage% -% tableau, ce qui contrastait nettement avec la forte similitude observée parmi les échantillons recueillis dans un seul figure B bénévole La similitude mesurée entre les prélèvements précoce et tardif, d’une part, et l’échantillon de fin de traitement, d’autre part, était encore plus faible, dans la plage% -% tableau

Figure Vue largeDownload slideA, Exemple de réaction en chaîne par polymérase Electrophorèse sur gel gradient dénaturant PCR DGGE empreintes digitales du microbiote fécal d’échantillons prélevés sur le patient pendant les cycles de chimiothérapie I-IV, montrant une diversité bactérienne décroissante et une faible similarité dans la composition des espèces. des échantillons de fin de traitement, donnant les pourcentages de similarité représentés AB, antibiotiques; N, l’échantillon prélevé des semaines après la fin du traitement B, les empreintes digitales PCR-DGGE de microbiote fécal des échantillons recueillis en série pendant une période d’un mois d’un seul contrôle sain des empreintes individuelles DGGE montrent une grande diversité d’espèces bactériennes dans chaque voie et un haut Les pourcentages reflètent la similitude mesurée entre les différentes empreintes microbiennes, comparée à celle de l’échantillon. Figure Vue large Télécharger la diapositive A, Exemple de réaction en chaîne par polymérase Electrophorèse en gel dénaturant PCR DGGE empreintes digitales du microbiote fécal des échantillons recueillis du patient pendant les cycles de chimiothérapie I-IV, montrant une diversité bactérienne décroissante et une faible similarité dans la composition des espèces pendant le traitement Les échantillons consécutifs sont comparés aux échantillons de fin de traitement, ce qui donne les pourcentages de similarité représentés AB, antibiotiques; N, l’échantillon prélevé des semaines après la fin du traitement B, les empreintes digitales PCR-DGGE de microbiote fécal des échantillons recueillis en série pendant une période d’un mois d’un seul contrôle sain des empreintes individuelles DGGE montrent une grande diversité d’espèces bactériennes dans chaque voie et un haut similitude entre les pistes consécutives Les pourcentages reflètent la similitude mesurée entre les différentes empreintes microbiennes, par rapport à celle de l’échantillon

Vue de la table largeTélécharger la diapositiveSimilarité des empreintes génétiques du microbiote à différents momentsTable Agrandir la photoTélécharger la diapositiveSimilarité des empreintes génétiques du microbiote à différents moments L’empreinte digitale de l’échantillon de fin de traitement montre une diversité comparable à celle d’un échantillon témoin sain. la grande variété interindividuelle dans les profils PCR-DGGE, les échantillons de patients n’ont pas été comparés avec des échantillons provenant de contrôles sains L’effet du traitement empirique avec des antibiotiques à large spectre Analysant les cycles de chimiothérapie sans antibiotiques thérapeutiques, aucune différence significative n’a été trouvée. similitude médiane entre les échantillons précoces et tardifs médiane,%; gamme, -, par rapport à la similitude médiane dans les cycles avec traitement antibiotique empirique médiane,%; L’effet de la phénethicilline sur le microbiote intestinal Chez les sujets témoins sains, nous avons étudié si le traitement par la phénéthicilline pouvait être lié à une diminution de la diversité microbienne. En comparaison des empreintes microbiennes fécales des échantillons prélevés jour et jour, une -% a été trouvé, ce qui est supérieur à la similarité médiane pour les échantillons de patients

Analyse quantitative du microbiote intestinal par FISH

À tous les moments pendant le traitement des échantillons précoces et tardifs, le nombre total de bactéries était significativement plus bas, comparé aux échantillons témoins sains. Les valeurs P variaient de la figure A. Aucune différence entre les échantillons de fin de traitement et le contrôle sain. échantillons, indiquant un nombre total restauré de bactéries des semaines après le dernier cycle de chimiothérapie Aucune différence significative n’a été observée entre les échantillons précoces et tardifs consécutifs

Figure Vue largeDownload slideNombre de bactéries dans les échantillons fécaux collectés au début du traitement tôt et tard pendant le traitement tardif pendant les cycles de chimiothérapie consécutifs, mesurés par analyse d’hybridation fluorescente in situ A, bactéries totales B, bactéries anaérobies C, Enterobacteriaceae D, Enterococcus faecium et Enterococcus faecalis E, Streptococci et lactocoques Tous les nombres pour les points précoces et tardifs sont significativement différents de ceux pour les échantillons témoins sains, sauf pour les entérocoques dans l’échantillon tardif P = Différences significatives entre les échantillons de fin de traitement et les échantillons témoins sains Dans les échantillons fécaux recueillis au début du traitement et plus tard pendant le traitement tard dans les cycles de chimiothérapie consécutifs, mesurés à l’aide de l’analyse d’hybridation fluorescente in situ. , À Bactéries B, bactéries anaérobies C, Enterobacteriaceae D, Enterococcus faecium et Enterococcus faecalis E, Streptocoques et lactocoques Tous les nombres pour les points précoces et tardifs sont significativement différents de ceux pour les échantillons témoins sains P & lt ;, sauf pour les entérocoques dans l’échantillon tardif P = Des différences significatives entre les échantillons de fin de traitement et les échantillons témoins sains ont été trouvées chez les entérocoques et les streptocoques, mais pas sur le nombre total de bactéries, anaérobies ou EnterobacteriaceaeNombre de bactéries anaérobies Le nombre médian de groupes prédominants de bactéries intestinales anaérobies-Bacteroides, Clostridium grappe XIVa, Faecalibacterium prausnitzii, et Bifidobacterium espèce-diminué – plié dans les échantillons pendant le traitement, comparé avec les échantillons témoins sains chiffre En fonction des différents points de temps, cela a entraîné une diminution du nombre total de bactéries anaérobies P les valeurs vont de la figure BA récupération a été trouvé pour les deux Clost Par contraste, les nombres totaux d’espèces de Bacteroides et de Bifidobacterium étaient encore – plus bas dans les échantillons de fin de traitement, comparés aux échantillons témoins sains. Le nombre total d’anaérobies les bactéries ne différaient pas significativement entre les échantillons de fin de traitement et les échantillons témoins sains

Figure Vue largeDownload slideNombre de bactéries anaérobies dans les échantillons fécaux collectés au début du traitement tôt et tard pendant le traitement tardif pendant les cycles de chimiothérapie consécutifs, mesurés par analyse d’hybridation fluorescente in situ A, Clostridium cluster XIVa B, Bifidobactéries C, Faecalibacterium prausnitzii D, espèces Bacteroides Tous les nombres pour les points de temps précoces et tardifs sont significativement différents de ceux pour les échantillons témoins sains P & lt; Des différences significatives entre les échantillons de fin de traitement et les échantillons témoins sains ont été trouvées chez les bifidobactéries et les espèces Bacteroides, mais pas chez Clostridium XIVa et F prausnitziiFigure View largeDownload slideDétaillant des bactéries anaérobies dans les échantillons fécaux collectés au début du traitement tôt et tard pendant le traitement tardif. cycles de chimiothérapie consécutifs, mesurés par analyse d’hybridation in situ fluorescente A, Clostridium cluster XIVa B, Bifidobactéries C, Faecalibacterium prausnitzii D, espèces de Bacteroides Tous les nombres pour les points de temps précoces et tardifs sont significativement différents de ceux des échantillons témoins sains P & lt; Des différences significatives entre les échantillons de fin de traitement et les échantillons témoins sains ont été trouvées chez les bifidobactéries et les espèces Bacteroides, mais pas chez Clostridium XIVa et F prausnitziiNombre de bactéries aérobies En accord avec l’utilisation prophylactique de la ciprofloxacine, aucune Enterobacteriaceae gram-négative n’a été détectée dans les échantillons fécaux recueillis pendant le traitement figure C Le nombre d’entérocoques était significativement plus élevé dans les échantillons de patients, comparé aux échantillons témoins sains, aux points de temps pendant les échantillons de traitement tôt, tôt, tard, tôt, tardif, précoce et tardif. En revanche, une diminution du nombre de streptocoques a été observée dans les échantillons de patients, par rapport aux échantillons témoins sains. Les valeurs de P variaient de la figure E. Le nombre de streptocoques n’était toujours pas récupéré. quelques semaines après le traitement Il est à noter que l’analyse microscopique a montré que certains échantillons ne contenaient que des cocci aérobies; le microbiote fécal contenait jusqu’à% entérocoques ou jusqu’à% streptocoques, ce qui était cohérent avec les empreintes digitales du DGGE montrant des espèces dominantes

Chimiothérapie et croissance bactérienne

Pour déterminer si la diminution du nombre de bactéries était le résultat de la chimiothérapie, la sensibilité de différentes espèces bactériennes aux agents chimiothérapeutiques utilisés dans & gt; Le cycle de chimiothérapie – daunorubicine, étoposide et cytarabine – a été déterminé In vitro, la daunorubicine et l’étoposide ont tous deux eu un effet négatif sur la croissance des bactéries anaérobies et aérobies L’utilisation d’une concentration plus élevée d’étoposide, mais pas de daunorubicine, a entraîné une diminution Dans la croissance bactérienne En revanche, la cytarabine n’a montré aucun effet sur la croissance des souches bactériennes testées

Discussion

La diversité était la plus faible pendant les cycles de chimiothérapie I et III, qui présentaient également les plus fortes incidences de toxicité intestinale. Cette découverte est en ligne avec les données de la littérature montrant que ces cycles de chimiothérapie, en particulier, provoquent une toxicité intestinale. et infection La diminution spectaculaire du nombre de bactéries anaérobies pourrait avoir un impact important sur la résistance à la colonisation. Elle pourrait également avoir un effet défavorable sur la production intestinale de butyrate, un facteur trophique essentiel à la formation d’entérocytes et un inhibiteur important de la L’augmentation des entérocoques pendant le traitement de la LMA pourrait impliquer un risque accru d’infection par des entérocoques résistants à la vancomycine, car tous les patients atteints de LMA donné un traitement empirique avec la vancomycine pendant les périodes de neutropénie ile Pour ce petit groupe de patients, nous n’avons pas pu tester cette hypothèse, ce qui en fait un axe de recherche ultérieur. Plusieurs facteurs peuvent être responsables de la diminution de la diversité et du nombre de microbiote intestinal chez les patients atteints de cancer. Tout d’abord, des recherches antérieures suggèrent que la nutrition est, au mieux, en partie responsable de l’effet dévastateur sur le microbiote chez les patients pédiatriques atteints de cancer Deuxièmement, dans notre étude, l’effet dévastateur sur le Le microbiote intestinal ne peut pas être utilisé uniquement en utilisant des antibiotiques prophylactiques, car la diversité des bactéries diffère entre les échantillons précoces et tardifs dans tous les cycles de chimiothérapie, bien que la prophylaxie ne soit pas interrompue entre eux. traitement par ciprofloxacine sur microbiote intestinal a été trouvé En outre, nous avons trouvé seulement un petit effet de traitement de la phénethicilline par voie orale Nous concluons donc que l’effet dévastateur sur la colonisation microbienne ne peut pas être exclusivement causé par l’utilisation d’antibiotiques prophylactiques. Les effets sur le microbiote intestinal ne peuvent pas non plus être attribués à l’utilisation d’antibiotiques à large spectre dans les cas La troisième cause possible, la chimiothérapie elle-même, a été testée in vitro. Tant la daunorubicine que l’étoposide ont montré un effet négatif direct sur la croissance bactérienne. Un effet direct de la cytarabine n’a pas été observé, ce qui pourrait s’expliquer par le fait que seuls ses métabolites exercent une activité cytotoxique Malheureusement, avec les techniques de laboratoire actuellement disponibles, il n’est pas possible de tester les taux chimiothérapeutiques dans les fèces. les résultats trouvés dans cette étude Cependant, même les doses les plus faibles o L’impact des médicaments chimiothérapeutiques sur la résistance à la colonisation nécessitera d’autres recherches. Dans cette étude, de multiples tests statistiques ont été effectués pour une petite population de patients. Cela pourrait introduire des résultats faussement positifs. même après une correction stricte de Bonferroni pour des tests multiples, la diminution des bactéries anaérobies est restée statistiquement significative, bien que les changements dans le nombre de streptocoques et d’entérocoques ne soient plus significativement différents entre échantillons de patients et échantillons de contrôle sains. conclusion de l’étude – le nombre de bactéries anaérobies diminue pendant le traitement de la LMA, augmentant ainsi la proportion de bactéries aérobies et potentiellement entéropathogènes telles que les entérocoques. À notre connaissance, nous sommes les premiers à démontrer, en utilisant les techniques de détection moléculaire DGGE et FISH. Les techniques de culture sic avec leurs inconvénients, que la combinaison de chimiothérapies, d’antibiotiques et d’alimentation artificielle a un effet important sur le microbiote intestinal. Des recherches supplémentaires devront être menées pour montrer si les changements dans la colonisation bactérienne jouent un rôle dans le développement et le maintien des muqueuses. des blessures, des infections et des syndromes inflammatoires, et si l’utilisation de prébiotiques, de probiotiques et de produits bactériens comme le butyrate pourrait jouer un rôle dans la prévention des lésions de la barrière muqueuse et de ses complications chikungunya. En conclusion, on a constaté une diminution considérable de la diversité microbienne intestinale. chez les patients atteints de LMA pendant le traitement, avec un équilibre perturbé entre les bactéries aérobies et anaérobies en faveur de cocci aérobies Gram positif potentiellement pathogènes Ces changements dans le microbiote réduisent la résistance à la colonisation des pathogènes Nous prévoyons que la diminution de la résistance à la colonisation augmente le risque de gram positif. infection aérobie chez les patients immunodéprimés ts

Remerciements

Nous remercions D Dimitropoulou et P C M van den Huijssen pour leur assistance technique. Soutien financier Fondation d’oncologie pédiatrique Bourse de recherche de Groningen à MJvVPotentiel de conflits d’intérêts Tous les auteurs: pas de conflits